Η Ε΄ Χειρουργική Κλινική εξυπηρετεί διδακτικές, ερευνητικές και νοσηλευτικές ανάγκες στο γνωστικό αντικείμενο της Γενικής Χειρουργικής και της Αγγειοχειρουργικής.
Η Κλινική συγκροτείται από τις μονάδες της Γενικής Χειρουργικής και της Αγγειοχειρουργικής.
Η Ε΄ Χειρουργική Κλινική αποτελεί ενιαία οντότητα, που απαρτίζεται από δύο τμήματα παράλληλα και αλληλένδετα λειτουργούντα.
Το κλινικό έργο ασκείται προς τρεις κατευθύνσεις την εκπαίδευση, την έρευνα και την κλινική εφαρμογή της Χειρουργικής και της Αγγειοχειρουργικής.